消化管の開口部として、口腔も気道と直接つながっています。口腔内の細菌、特に嫌気性細菌は、消化管や気道に直接入ることができます。通常の状況下では、これらは疾患の原因ではありませんが、抵抗力の低い「感受性の高い人」または関連する慢性疾患では、慢性胃炎、胃潰瘍、肺感染症、さらには肺膿瘍などの深部臓器の疾患を引き起こす可能性があります。

さらに、一部の全身性疾患では、口腔内で対応する兆候が見られる場合があります。たとえば、糖尿病患者は抗感染能力が低下し、歯周炎を伴うことが多く、抜歯創は治癒が困難であり、エイズ患者は初期に口腔病変、口腔カンジダ症および他の疾患を患います。白血病患者はしばしば歯茎の腫脹と出血を起こし、一部の患者は他の明らかな全身症状が現れる前に歯科医によって最初に発見されます。
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